در اولین جلسه رسمی شورای اسلامی شهر مبارکه در دوره ششم، سید امین اله موسوی به عنوان سرپرست شهرداری انتخاب شد.
نخستین دستور جلسه شورای شهر مبارکه پس از مراسم تحلیف به انتخاب سرپرست شهرداری اختصاص داشت که در این جلسه سید امین اله موسوی با اتفاق آرا ، به عنوان سرپرست شهرداری مبارکه انتخاب و مقرر شد تا زمان انتخاب شهردار وظیفه انجام کارهای مربوط به شهرداری را بر عهده بگیرد.
وی در دوره پنجم مدیریت شهری، سمت مدیرعامل سازمان عمران و بازآفرینی شهری را بر عهده داشت.